圣托马斯大学圣保罗神学院建立于1894年，是一所私立机构。学院拥有7英亩地的校园，毗邻圣托马斯大学的主校。自圣托马斯大学圣保罗神学院成立以来，超过3000位毕业于圣托马斯大学圣保罗神学院的学生被任命为牧师，其中包括33位神圣主教、两位大主教。圣托马斯大学圣保罗神学院的任务是为罗马天主教会部长级僧侣候选人作准备。圣托马斯大学圣保罗神学院符合罗马天主教的神学教育和机构设置的传统的最高标准。圣托马斯大学圣保罗神学院作为一所研究生神学院的任务是，使人们准备服务和领导教堂和社会。圣托马斯大学圣保罗神学院提供神学硕士、文学硕士（神学）、文学硕士（宗教教育）等硕士学位课程。圣托马斯大学圣保罗神学院被中北部学院和学校联合会、美国与加拿大神学校联合会所认证。